Le Haut Commissariat aux Eaux et Forêts et à la Lutte Contre la Désertification comprend, outre le cabinet du Haut Commissaire, une administration centrale et des services déconcentrés.

- Le Cabinet.

L'administration centrale

- Le Secrétariat Général.

- L'Inspection Générale.

- La Direction de la Planification, du Système d'Information et de la Coopération.

- La Direction de la Lutte contre la Désertification et de la Protection de la Nature.

- La Direction du Développement Forestier.

- La Direction du Domaine Forestier, des Affaires Juridiques et du Contentieux.

- La Direction des Ressources Humaines et des Affaires Administratives.

- Le Centre de Recherche Forestière.

Les services extérieurs

- 12 Directions Régionales des Eaux et Forêts et de Lutte Contre la Désertification.

- Le Parc zoologique National de Rabat.

- Le Centre National d'Hydrobiologie et de Pisciculture d'Azrou.

Organigramme régional

- Direction Régionale du Nord Ouest - Kénitra.

- Direction Régionale de Rabat-Salé-Zemmour-Zair - Khemisset.

- Direction Régionale du Centre - Casablanca.

- Direction Régional de Tadla Azillal - Béni Mellal.

- Direction Régionale du Moyen Atlas - Meknès.

- Direction Régionale de Fès-Boulemane - Fès.

- Direction Régionale du Rif - Tétouan.

- Direction Régionale du Nord Est -Taza.

- Direction Régionale de l'Oriental - Oujda.

- Direction Régionale du Haut Atlas - Marrakech.

- Direction Régionale du Sud Ouest - Agadir.

- Direction Régionale du Sud - Laayoune.